鄭南榕，在戒嚴那風聲鶴唳的年代，發行《自由時代》週刊批判時事，公開主張「台灣獨立」。1989年4月7日，鄭南榕為了堅持百分百言論自由、拒絕因刊登台灣新憲法草案遭判亂罪起訴逮捕，於雜誌社自囚71天後自焚殉道。

為了紀念並延續南榕的理念，基金會及紀念館於1999年在自由時代雜誌社舊址成立，台灣的民主未來，接下來就是我們的事了。